双创是发挥“创新发展”第一动力作用的重大供给侧实践选择。近些年，财税部门把调控管理、深化改革和改善服务相结合，在支持双创中做出了值得肯定的成绩，同时也还存在一些问题。对于双创，财政政策及管理工具涉及税收优惠、政策性投融资、专项转移支付、财政补贴、会计制度、经费使用的管理规则等，也涉及部门间协调。笔者认为有如下几方面值得重视：
一是部分政策规定过于复杂，可操作性不高。如科技企业孵化器优惠政策，对孵化器提出三项条件，再对孵化企业设定七个要求，导致政策覆盖面过窄。
二是由各部门去甄别哪些企业享受优惠，自由裁量权较大，容易造成不公平竞争和设租寻租。如创业投资企业的所得税优惠政策，要求企业必须登记为“专业性法人创业投资企业”，将非专业性法人创业投资企业排除在外，而且概念颇有弹性，如何界定专业性与非专业性，容易滑向靠“处关系”来解决的状态。
三是仍然存在空白地带，如有关规定要求制定对众创空间、天使投资的税收优惠政策，但至今尚未出台。
四是部门间协调不顺，形成扯皮、推诿、紊乱。如《企业所得税法》对小型微利企业有划分标准，工信部又对于中小微企业有划分标准，实际上导致相关概念的“标准化”程度低、往往出现莫衷一是的尴尬结果；又如科技部门和税务部门对科技企业孵化器的认定和条件控制不一，使优惠政策难以落地。
五是“营改增”面临一些具体矛盾与挑战有待破解。比如高科技企业和高智力轻资产的咨询公司，进项抵扣很少，实际税负高，应考虑作出针对性区别对待。比如公路交通运输的几百万辆货运卡车，绝大部分为在全国随机流动接单运营的个体车主车辆，已无法按“有车承运”为前提的税制设计与进项抵扣规定在车主原籍操作，必须适应“无车承运”物流平台公司的现实发展，对接这些平台公司的大数据系统，来落实该行业“营改增”的实施细则。
但是具体方案迟迟不能在管理部门形成，迫使无车承运业务要伪装有车承运的成本构成，已催生了多种潜规则乱象，结算中以过路过桥费票、加油卡等找利益平衡，乃至向燃油销售企业购买发票等等，抬高经济活动成本，引发设租寻租和经济秩序紊乱，严重扭曲、损害了该行业“营改增”的“激励创新”效应。
在“问题导向”下，必须积极寻求解决之策。笔者提出如下建议：一是支持双创的各项政策，需要作出反思与优化，力求明白简洁，有可操作性。二是对部门的“甄别”、“定性”实权，应力求有所限制约束，流程应力求阳光化，把“设租寻租”的可能性尽量压低。三是积极填补政策空白，确有必要的政策设计，应抓住不放一抓到底，力求尽快落实操作细则和配套措施。四是结合政府部门架构改革、职能转变，应有效加强和优化相互协调机制，对双创的方方面面，科技企业孵化器的种种细节，各部门尽力排除扯皮、拖延现象。五是针对诸如公路交通运输互联网、大数据时代必发展的“无车承运”公司等现实情况，及时组织“营改增”具体方案如何优化的专题调研，力求尽快解决问题。六是高度重视、及时合理规定PPP创新中的政策界限，引导、鼓励专业人士为PPP项目作智力支持并取得合法收入。