遭海湾邻国集体断交和禁运将近两个月后，卡塔尔终于决定向国际组织告状。7月31日晚，卡塔尔经济与贸易部发表声明说，已向世界贸易组织（WTO）申诉，抗议沙特阿拉伯、阿拉伯联合酋长国和巴林对其“非法封锁”。
声明说，卡塔尔已向世贸组织的争端解决机制发起申诉，“指控实施封锁的国家违反世贸组织核心法规、货物与服务贸易惯例和知识产权的贸易相关条例”。
卡塔尔经贸大臣谢赫艾哈迈德·本·贾西姆·本·穆罕默德·阿勒萨尼在声明中说，“封锁国采取的禁运措施明显违反国际贸易法的条款和惯例”，而且，此次非法封锁在世贸组织框架下可谓“前所未有”。
阿勒萨尼当天造访瑞士日内瓦世贸组织总部，与世贸组织总干事罗伯托·阿泽维多会面，并与擅长处理贸易争端的律师商谈。
6月5日，沙特、巴林、阿联酋和埃及等国宣布与卡塔尔“断交”，理由是后者支持极端组织、破坏地区稳定，随后对卡塔尔施以海陆空禁运。沙特等国向卡塔尔提出关闭半岛电视台、与伊朗关系降级、关闭境内土耳其军事基地等要求，作为复交和解除禁运的条件。卡塔尔否认指控，也拒绝接受这些苛刻的条件，指其损害主权。
同为海湾阿拉伯国家的科威特协助调停这场危机，一些西方国家也从中斡旋，但迄今为止未取得任何重要进展。
按照世贸组织规定，申诉后争端各方可在６０天内通过谈判解决争端，如果谈判破裂，卡塔尔可要求成立一个独立工作组，后者有权强制另外三国解除封锁，否则将面临惩罚。